正常睪丸位于陰囊內，陰囊壁能調節局部溫度使其略低于體溫，以維持睪丸的正常功能。隱睪則受環境相對高溫（體溫）的影響，加上先天的發育不全因素，因而睪丸發育停滯、生精細胞數量減少且成熟度差，曲精細管發育不全，間質纖維化，各種細胞〔精原細胞、間質細胞、支持細胞（塞爾托利氏細胞）〕退行性變化等組織病變。并且發現單側隱睪的對側陰囊睪丸，亦早期存在相同的組織學病變，故常使單側隱睪者不育。
病變發生的時間并不一致，近年研究發現生命第1年中隱睪與正常睪,二者基本沒有區別，從第3年起（即2足歲后）存在輕度病理改變，3歲后明顯，以后隨著年齡增長而病理改變越趨嚴重,精子形成過程障礙,最后造成不育。據調查雙側隱睪70~100%無生育力,亦可有男性內分泌不足的現象，治療后生育率亦僅40~50%。單側隱睪60~85％生育力低下或不育，治療后生育力可達60~80%。
位置不正常的睪丸，尤其位于腹膜后者，發生腫瘤的機會為正常睪丸的30~50倍，睪丸腫瘤中8~15%發生于隱睪，高發年齡在25~35歲。隱睪惡變的原因，可能與年齡增大，睪丸位置，環境溫度，生精上皮萎縮，激素失衡等有關，早期治療可減少這種危險。由于睪丸位于腹股溝管內或恥骨結節附近，比較表淺、固定、容易受到直接損傷，精索扭轉的發生率亦高。（實習編輯：張嵐）
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