小腸結腸炎耶爾森菌可引起腹瀉與腸外疾患。
本菌為革蘭氏陰性小桿菌，有毒菌株多呈球桿狀，無毒株以桿狀多見。對營養要求不高，能在麥康凱瓊脂上生長，但較其他腸道桿菌生長緩慢，培養的最適宜溫度為28℃，最適ph值為7～8，初次培養菌落為光滑型，通過傳代接種后菌落可能呈粗糙型。
本菌具有“嗜冷性”，在水中和低溫下(4℃)能生長，為腸道中能在4℃生長繁殖的少數細菌之一。因此，食品冷藏保存時，應防止被該菌污染。
野生動物、家畜(豬、狗和貓)、牡蠣和水源中都能分離到本菌，亦可從健康人或患者糞便中分離得到，其傳播方式可能與攝入被尿、糞便污染的食物(尤其是肉類)和接觸感染動物等有關。
本菌可產生耐熱腸毒素，121℃30分鐘不被破壞，對酸堿穩定，ph1～11不失活。腸毒素產生迅速，在25℃下培養12小時，培養基上清液中即有腸毒素產生，24～48小時達高峰。腸毒素是引起腹瀉的主要因素。毒力型菌株均有vw抗原(蛋白脂蛋白復合物)，為毒力的重要因子，與侵襲力有關，侵襲力可能是耶爾森菌感染腸道表現的病理基礎。
病變部位主要累及回腸及結腸粘膜，造成彌漫性充血，有多個大小不等的淺表潰瘍，可深達固有層，嚴重者可引起穿孔及出血。
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