對于強直性脊柱炎的病因，目前醫學界暫不清楚;據研究;認為與下列因素有關。
(1) 遺傳因素
本病在不同民族中發病率的差異很大，北美印第安人發病率為 2.7%～ 6.3%，而在非洲發病率僅為 0.2%。美國白人發病率為0.18%～1.4%，黑人發病率約為白隊舶1/4。據調查，強直性脊柱炎病人親屬中發病率比一般人高加倍左右。有人研究，發現多對攣生兄弟先后出現強直性脊柱炎。強直性脊柱炎病人hla—b27(人類白細胞抗原b27)陽性率高達90%以上，子女hla—b27陽性占50%，發生強直性脊柱炎的占25%。強直性脊柱炎比類風濕關節炎具有更強的家族遺傳傾向。這說明遺傳因素對本病起著決定性作用。筆者在統計100例強直性脊柱炎病人中，hla—b27陽性率為88%，發現15例有家族史，其中父親、兄弟先后同患該病的有11例。國內有組報道，210例強直性脊柱炎病人中，男性約占93%，說明影響強直性脊柱炎發病的因素不僅限于hla—b27。已知hla—b27陽性者僅20%發生強直性脊柱炎，這也說明在發病因素中還有其他因素起作用。
(2) 感染因素
有些學者經過大量觀察，發現不少男性強直性脊柱炎病人合并有前列腺炎。另外有一些專家發現，本病病人中，潰瘍性結腸炎和局限性腸炎的發病率較一般人高，從而推測致病因素可能是感染。最近有學者研究認為，感染源可能是腸道肺炎克雷白菌。他們在實驗中發現，無論是強直性脊柱炎病人大便肺炎克雷白菌培養陽性率，還是血清抗肺炎克雷白菌抗體水平，均顯著高于對照組。有些學者認為，耶爾森菌也可能是該病的致病因子。
(3) 其他致病因素
包括上呼吸道感染、外傷、甲狀腺疾病、肺結核、局部感染等，但都缺乏足夠的證據。
由此可見，目前尚無一種學說能夠闡明強直性脊柱炎的全部病因，可能是在遺傳基礎上，加上感染等多方面的影響而發病。
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